根據新政發[2013]39號文件《關于取消和調整行政審批事項的決定》，取消的行政許可事項共29項：其中涉及衛生廳（6項）：水處理材料中的無煙煤、骨炭、二氧化鈦、聚丙烯、聚氯乙烯、碘樹脂、電解槽、電極產品衛生許可。水質處理器中的陶瓷凈水器，飲用水PH調節器，氧化電位水發生器，除氟、除砷凈水器產品衛生許可等6項內容。
        調整的行政許可和非行政許可審批事項中，國務院規定由自治區級下放管理層級的事項共28項：其中涉及衛生廳（2項）：飲用水供水單位衛生許可，下放后實施機關：州、市（地）級、縣級人民政府衛生行政部門等2項。調整后共有4項合并的事項，其中涉及水利廳（3項）：1.原由水利廳實施的，（1）水工程建設項目防洪規劃審核；（2）水工程建設項目流域綜合規劃審批等2項合并為1項，即：“水工程建設規劃同意書審查”。2.“因施工作業需要搬遷、拆除漁業航標審批”并入“漁業航標設置、撤除、位置移動和其他狀況改變審批”。